Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SCAF1Q9H7N4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SCAF1Q9H7N4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SCAF1Q9H7N4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SCAF1Q9H7N4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SCAF1Q9H7N4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF1Q9H7N4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms