Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXO5Q9H790 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXO5Q9H790 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EXO5Q9H790 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXO5Q9H790 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO5Q9H790 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms