Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EHD1Q9H4M9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD1Q9H4M9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD1Q9H4M9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD1Q9H4M9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms