Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S4

TPK1, Thiamin pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPK1Q9H3S4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPK1Q9H3S4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPK1Q9H3S4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPK1Q9H3S4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPK1Q9H3S4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPK1Q9H3S4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms