Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MIXL1Q9H2W2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIXL1Q9H2W2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIXL1Q9H2W2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms