Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC68Q9H2F9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC68Q9H2F9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC68Q9H2F9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC68Q9H2F9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms