Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZMYND12Q9H0C1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND12Q9H0C1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZMYND12Q9H0C1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZMYND12Q9H0C1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZMYND12Q9H0C1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms