Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A4Q9H015 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A4Q9H015 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A4Q9H015 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms