Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN2Q9H000 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN2Q9H000 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN2Q9H000 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN2Q9H000 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN2Q9H000 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN2Q9H000 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN2Q9H000 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN2Q9H000 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN2Q9H000 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN2Q9H000 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN2Q9H000 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN2Q9H000 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms