Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR12Q9C0I1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR12Q9C0I1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTMR12Q9C0I1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR12Q9C0I1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR12Q9C0I1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR12Q9C0I1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR12Q9C0I1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR12Q9C0I1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR12Q9C0I1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms