Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIPCQ9C0C6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIPCQ9C0C6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CIPCQ9C0C6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms