Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PINK1Q9BXM7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PINK1Q9BXM7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PINK1Q9BXM7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PINK1Q9BXM7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PINK1Q9BXM7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms