Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VN1R3Q9BXE9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VN1R3Q9BXE9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VN1R3Q9BXE9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VN1R3Q9BXE9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VN1R3Q9BXE9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VN1R3Q9BXE9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms