Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCAR1Q9BXC0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HCAR1Q9BXC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCAR1Q9BXC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCAR1Q9BXC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms