Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLVAPQ9BX97 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLVAPQ9BX97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLVAPQ9BX97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLVAPQ9BX97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms