Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REPIN1Q9BWE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REPIN1Q9BWE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REPIN1Q9BWE0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REPIN1Q9BWE0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REPIN1Q9BWE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms