Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIFC3Q9BVG8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIFC3Q9BVG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIFC3Q9BVG8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIFC3Q9BVG8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIFC3Q9BVG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KIFC3Q9BVG8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIFC3Q9BVG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIFC3Q9BVG8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIFC3Q9BVG8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIFC3Q9BVG8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIFC3Q9BVG8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms