Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFAF3Q9BU61 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NDUFAF3Q9BU61 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFAF3Q9BU61 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFAF3Q9BU61 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDUFAF3Q9BU61 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms