Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MTA3Q9BTC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MTA3Q9BTC8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MTA3Q9BTC8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MTA3Q9BTC8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MTA3Q9BTC8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MTA3Q9BTC8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MTA3Q9BTC8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms