Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2Q9BSQ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCM2Q9BSQ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCM2Q9BSQ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCM2Q9BSQ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms