Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF1Q9BSM1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF1Q9BSM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF1Q9BSM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF1Q9BSM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF1Q9BSM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF1Q9BSM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF1Q9BSM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF1Q9BSM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF1Q9BSM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms