Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRADC1Q9BSG0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRADC1Q9BSG0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRADC1Q9BSG0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms