Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SH2D3AQ9BRG2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2D3AQ9BRG2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2D3AQ9BRG2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SH2D3AQ9BRG2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms