Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM1Q9BR11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSWIM1Q9BR11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZSWIM1Q9BR11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZSWIM1Q9BR11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZSWIM1Q9BR11 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSWIM1Q9BR11 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSWIM1Q9BR11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms