Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LPIN3Q9BQK8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LPIN3Q9BQK8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LPIN3Q9BQK8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LPIN3Q9BQK8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LPIN3Q9BQK8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms