Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT3Q9BQG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT3Q9BQG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT3Q9BQG1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT3Q9BQG1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms