Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX50Q9BQ39 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX50Q9BQ39 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDX50Q9BQ39 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX50Q9BQ39 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX50Q9BQ39 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms