Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBBP8Q99708 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RBBP8Q99708 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP8Q99708 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms