Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDNQ99608 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDNQ99608 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDNQ99608 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NDNQ99608 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDNQ99608 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDNQ99608 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NDNQ99608 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDNQ99608 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDNQ99608 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDNQ99608 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDNQ99608 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDNQ99608 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDNQ99608 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDNQ99608 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NDNQ99608 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDNQ99608 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDNQ99608 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDNQ99608 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDNQ99608 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDNQ99608 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDNQ99608 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDNQ99608 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDNQ99608 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NDNQ99608 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
NDNQ99608 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDNQ99608 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDNQ99608 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDNQ99608 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDNQ99608 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDNQ99608 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDNQ99608 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDNQ99608 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDNQ99608 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDNQ99608 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDNQ99608 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDNQ99608 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDNQ99608 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NDNQ99608 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDNQ99608 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDNQ99608 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDNQ99608 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDNQ99608 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDNQ99608 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NDNQ99608 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDNQ99608 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDNQ99608 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDNQ99608 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDNQ99608 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDNQ99608 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDNQ99608 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDNQ99608 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDNQ99608 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDNQ99608 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDNQ99608 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDNQ99608 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDNQ99608 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDNQ99608 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDNQ99608 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDNQ99608 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDNQ99608 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDNQ99608 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDNQ99608 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDNQ99608 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDNQ99608 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDNQ99608 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDNQ99608 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDNQ99608 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDNQ99608 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDNQ99608 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDNQ99608 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDNQ99608 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDNQ99608 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDNQ99608 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDNQ99608 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDNQ99608 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDNQ99608 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDNQ99608 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NDNQ99608 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDNQ99608 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDNQ99608 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDNQ99608 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDNQ99608 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDNQ99608 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDNQ99608 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDNQ99608 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDNQ99608 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDNQ99608 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDNQ99608 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDNQ99608 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDNQ99608 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDNQ99608 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDNQ99608 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NDNQ99608 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDNQ99608 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDNQ99608 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDNQ99608 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDNQ99608 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDNQ99608 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDNQ99608 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms