Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SCAF11Q99590 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SCAF11Q99590 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SCAF11Q99590 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SCAF11Q99590 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SCAF11Q99590 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SCAF11Q99590 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAF11Q99590 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SCAF11Q99590 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SCAF11Q99590 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.7 ms