Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSMD1Q99460 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSMD1Q99460 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PSMD1Q99460 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSMD1Q99460 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PSMD1Q99460 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSMD1Q99460 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSMD1Q99460 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms