Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UHRF1Q96T88 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UHRF1Q96T88 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UHRF1Q96T88 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UHRF1Q96T88 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UHRF1Q96T88 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms