Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX1Q96RV3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX1Q96RV3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX1Q96RV3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX1Q96RV3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms