Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PLIN4Q96Q06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLIN4Q96Q06 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLIN4Q96Q06 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLIN4Q96Q06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms