Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK3Q96PN8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSSK3Q96PN8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK3Q96PN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK3Q96PN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK3Q96PN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms