Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RUNDC3BQ96NL0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUNDC3BQ96NL0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC3BQ96NL0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC3BQ96NL0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms