Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN5Q96NI6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN5Q96NI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN5Q96NI6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRFN5Q96NI6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN5Q96NI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms