Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFXN2Q96NB2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFXN2Q96NB2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFXN2Q96NB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms