Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSNARE1Q96NA8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSNARE1Q96NA8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSNARE1Q96NA8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms