Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX22Q96L94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX22Q96L94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX22Q96L94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX22Q96L94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms