Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRR1Q96L50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRR1Q96L50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRR1Q96L50 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRR1Q96L50 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms