Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CABS1Q96KC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CABS1Q96KC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CABS1Q96KC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CABS1Q96KC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABS1Q96KC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms