Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIC2Q96JB3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIC2Q96JB3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIC2Q96JB3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIC2Q96JB3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms