Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A3Q96HJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A3Q96HJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A3Q96HJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms