Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ACSBG1Q96GR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ACSBG1Q96GR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ACSBG1Q96GR2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ACSBG1Q96GR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ACSBG1Q96GR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ACSBG1Q96GR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ACSBG1Q96GR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms