Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN17Q96FV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSPAN17Q96FV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms