Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHFRQ96EP1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHFRQ96EP1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHFRQ96EP1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHFRQ96EP1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHFRQ96EP1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms