Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF21BQ96EK2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF21BQ96EK2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF21BQ96EK2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF21BQ96EK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF21BQ96EK2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF21BQ96EK2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF21BQ96EK2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF21BQ96EK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF21BQ96EK2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF21BQ96EK2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF21BQ96EK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF21BQ96EK2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF21BQ96EK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF21BQ96EK2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms