Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC126Q96EE4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC126Q96EE4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC126Q96EE4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms