Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP3Q96DZ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP3Q96DZ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP3Q96DZ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP3Q96DZ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP3Q96DZ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP3Q96DZ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP3Q96DZ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIP3Q96DZ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP3Q96DZ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms